Standard mäßig wird unter Ubuntu das OpenJDK installiert, was jedoch mit einigen Java Anwendungen Probleme verursacht. Es macht meiner Meinung nach mehr Sinn, die JRE direkt von Sun zu installieren.
add-apt-repository ppa:sun-java-community-team/sun-java6 apt-get update apt-get install sun-java6-jre
Java Version auf Java-6-sun wechseln
update-java-alternatives -s java-6-sun
Version kontrollieren
java -version java version "1.6.0_22" Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_22-b04) Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 17.1-b03, mixed mode)